Визуализация в медицине

СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПАРАМЕТРОВ ДЛЯ ИСКЛЮЧЕНИЯ АРТЕФАКТОВ ИЗОБРАЖЕНИЯ НА ЦИФРОВЫХ МИКРОФОТОГРАФИЯХ

  • А.В. Леванчук Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет. 194100, Российская Федерация, г. Санкт-Петербург, ул. Литовская, д. 2
  • М.А. Дохов Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет. 194100, Российская Федерация, г. Санкт-Петербург, ул. Литовская, д. 2
  • А.А. Тихомирова Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет. 194100, Российская Федерация, г. Санкт-Петербург, ул. Литовская, д. 2
  • В.Е. Стернин Санкт-Петербургский государственный педиатрический медицинский университет. 194100, Российская Федерация, г. Санкт-Петербург, ул. Литовская, д. 2
Ключевые слова:
компьютерная морфометрия анализ микрофотографий морфометрические характеристики computer morphometry medical cell images morphometric characteristics

Аннотация

Цель исследования. Определение параметров исключения артефактов изображения на цифровых микрофотографиях лимфоцитов. Материалы и методы. Анализ публикаций в РИНЦ, Scopus; цифровые микрофотографии для оценки количества клеток в поле зрения. Исследование проводилось с помощью открытого программного обеспечения для анализа биомедицинских изображений QuPath. Использованы цифровые микрофотографии лимфоцитов с мануальной разметкой для подсчета клеток, находящиеся в открытых базах данных openmicroscopy.org и openslide.org. Для автоматического подсчета определялись линейные характеристики: длина ядра, радиус кривизны, угловые параметры; площадные характеристики: периметр, площадь, ориентация, проекции на оси X и Y, длина максимальной и минимальной осей; коэффициенты формы: длина, квадратичность, сферичность, округлость. Результаты. Обработаны цифровые микроизображения (n=69) лимфоцитов человека. Проведена статистическая обработка результатов ручного, автоматического и автоматического подсчета с коррекцией. Выводы. Корректировка набора параметров дала статистически значимый результат, позволяющий отсеять артефакты и учитывать только клетки.

Как цитировать
СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПАРАМЕТРОВ ДЛЯ ИСКЛЮЧЕНИЯ АРТЕФАКТОВ ИЗОБРАЖЕНИЯ НА ЦИФРОВЫХ МИКРОФОТОГРАФИЯХ. (2023). Визуализация в медицине, 4(4), 3-6. https://visual-med.ru/article/view/5753
Выпуск
Том 4 № 4 (2022)
Раздел
Статьи
Опубликован
2023-11-29

Как цитировать

СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ОПРЕДЕЛЕНИЮ ПАРАМЕТРОВ ДЛЯ ИСКЛЮЧЕНИЯ АРТЕФАКТОВ ИЗОБРАЖЕНИЯ НА ЦИФРОВЫХ МИКРОФОТОГРАФИЯХ. (2023). Визуализация в медицине, 4(4), 3-6. https://visual-med.ru/article/view/5753